【２】主な機器の紹介
［2.1］DNA シークエンサー（ALFexpress）
- 設置場所：
- 機器分析室（502）
- 品 名：
- DNA シークエンサー ALFexpress ツインシステム
ファルマシアバイオテク（株） （スウェーデン）
- 性 能：
(１）ALFexpress は、１種類の蛍光色素（Cy-5）を用いて標識を行うため、色素間の補正のない生データ を確認できます。
(２）温水循環によるゲルの温度制御が可能であるため、再現性および温度均一性の高い電気泳動が可能 であり、泳動時の歪みを抑えることができます。
(３）コンピューターによる多処理（マルチタスク操作）が可能であるため、泳動中にも解析ができます。 また２台のシークエンサーを各々独立して制御できるため、同時または泳動開始時間に差が生じても時間の無駄がなく、効率の高い実験が可能です。
(４）１台に１０サンプル、２台で２０サンプル同時に泳動することが可能です。
(５）１時間当たりに決定可能な塩基配列が２２５baseと多く、３００ ベースのシークエンスを８０分（ショートプレート使用）で、７００ベースのシークエンスを ８時間（スタンダードプレート）で解析することが出来ます。
- 利用者負担金：
- シーケンサー本体の使用料金は取りません。その代わり、シーケンスゲルを作製するために、遺伝 子実験施設で購入している「Long Ranger gelsolution（タカラ、F0611）」を使用する場合は、使用記録 ノートの該当欄に使用量（ml）を記入し、１ml あたり１００円を試薬代として集めることにしました。 「ALFexpress」のプロトコールでは、ゲル１枚につき「Long Ranger」を約９ml 使用しますので、試薬 代は９００円になります。もちろん、遺伝子実験施設の「Long Ranger」を使わない場合、試薬代は無料です。
なお、これまで、試薬調製室の試薬棚に保管していた「Long Ranger gelsolution 」は、機器分析室 （502）内の「ALFexpress」と「ABI PRISM 7700」の間にある試薬棚に移しました。 最近の傾向として、 ゲルを作製する必要がないキャピラリーシーケンサーに人気が集まり、「ALFexpress」や「LI-COR, 4200」を使用する人はあまりいません。しかしながら、キャピラリーシーケンサーと比較した場合、これらのシーケンサーには下記メリットがあります。是非ご利用下さい。
・正確に読める。
・長く読める。
・安く読める。（サンプルが多い場合）
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