******** GTC On Line News No.387*******
      2003年 5月 8日
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 本日、午後1時30分から、GTC On Line News No.378(2003年4月17日) でお知らせした、第32回遺伝子技術講習会を開催します。多数の方のご参加をお待 ちしています。

======= 第32回遺伝子技術講習会 =======

タイトル;配列解析、どうしてる!?
  === 配列データの解析・検索に手間暇かけていませんか? ===

ソフト;Vector NTI Suite 7.0(World Fusion)
サーバーマシン;Fujitsu FMV7000FL2(Windows2000)
クライアントマシン;Mac and Win
場 所;遺伝子実験施設・6階・講義室(602号室)

日 時:平成15年 5月 8日(木) 13:30〜14:30
     [使用説明会 14:30〜16:00]

講 師;株式会社 World Fusion  佐野 康子 氏

内容;
 遺伝子解析ソフトVector NTI Advanceを使った核酸/アミノ酸配列の包括的 な解析をみてみましょう。配列データの解析・検索ツールが迅速に実行できます。
〜〜〜Vector NTI Advanceって?
 世界で最も利用されている遺伝子解析ソフトウェアです。核酸配列の解析だけ に留まらず、プロテオミクス解析を視野に入れたアミノ酸配列解析ツールも充実 しています。様々な配列上の情報をグラフィック表示するので操作性抜群、解析 結果一目瞭然です。

〜〜〜どんなツールを持っているの?
 こんなツールを持っています。

 Vector NTI:配列の編集・ORFサーチ・制限酵素マッピング・Primer設計・アミノ酸翻訳データ作成・モチーフ登録,検索・Feature追加など基本データ編集。
 AlignX: ClastalWを用いたアライメントとドットプロット解析。
 ContigExpress:アッセンブル(各種シークエンサーからのデータに対応)
 BioAnnotator:Pfam, PROSITE, Blocksデータベースを用いたローカルモチーフ検索とGC含量, 融点計算, 二次構造予測, 疎水性/親水性計算など配列分析。
 GenomBench:ゲノム配列(UCSC, Ensembl)のアノテーション情報の参照,ダウンロードやBLATサーチ。
 Blast Search:VNTIから直接NCBI BLASTサーバーへ検索。結果ビューアーで楽に確認。
 PubMed-Entrez Search:キーワードによる文献検索。高次構造ビューアー付き。

※Vector NTIはデータベースエクスプローラーで上記ツールで解析、  検索した結果や配列データを一元管理します。

 今回、この講習会ではVNTIが持っている機能を皆様に知っていただくため、 その概要を説明いたします。皆様ふるってご参加ください。

<GTC On Line News>

<GTC On Line News-351-400>


熊本大学・遺伝子実験施設; E-mail:www@gtc.gtca.kumamoto-u.ac.jp