******** GTC On Line News No.387*******
2003年 5月 8日
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本日、午後1時30分から、GTC On Line News No.378(2003年4月17日)
でお知らせした、第32回遺伝子技術講習会を開催します。多数の方のご参加をお待
ちしています。
======= 第32回遺伝子技術講習会 =======
タイトル;配列解析、どうしてる!?
=== 配列データの解析・検索に手間暇かけていませんか? ===
ソフト;Vector NTI Suite 7.0(World Fusion)
サーバーマシン;Fujitsu FMV7000FL2(Windows2000)
クライアントマシン;Mac and Win
場 所;遺伝子実験施設・6階・講義室(602号室)
日 時:平成15年 5月 8日(木) 13:30〜14:30
[使用説明会 14:30〜16:00]
講 師;株式会社 World Fusion 佐野 康子 氏
内容;
遺伝子解析ソフトVector NTI Advanceを使った核酸/アミノ酸配列の包括的
な解析をみてみましょう。配列データの解析・検索ツールが迅速に実行できます。
〜〜〜Vector NTI Advanceって?
世界で最も利用されている遺伝子解析ソフトウェアです。核酸配列の解析だけ
に留まらず、プロテオミクス解析を視野に入れたアミノ酸配列解析ツールも充実
しています。様々な配列上の情報をグラフィック表示するので操作性抜群、解析
結果一目瞭然です。
〜〜〜どんなツールを持っているの?
こんなツールを持っています。
Vector NTI:配列の編集・ORFサーチ・制限酵素マッピング・Primer設計・アミノ酸翻訳データ作成・モチーフ登録,検索・Feature追加など基本データ編集。
AlignX: ClastalWを用いたアライメントとドットプロット解析。
ContigExpress:アッセンブル(各種シークエンサーからのデータに対応)
BioAnnotator:Pfam, PROSITE, Blocksデータベースを用いたローカルモチーフ検索とGC含量, 融点計算, 二次構造予測, 疎水性/親水性計算など配列分析。
GenomBench:ゲノム配列(UCSC, Ensembl)のアノテーション情報の参照,ダウンロードやBLATサーチ。
Blast Search:VNTIから直接NCBI BLASTサーバーへ検索。結果ビューアーで楽に確認。
PubMed-Entrez Search:キーワードによる文献検索。高次構造ビューアー付き。
※Vector NTIはデータベースエクスプローラーで上記ツールで解析、
検索した結果や配列データを一元管理します。
今回、この講習会ではVNTIが持っている機能を皆様に知っていただくため、
その概要を説明いたします。皆様ふるってご参加ください。
<GTC On Line News>
<GTC On Line News-351-400>
熊本大学・遺伝子実験施設; E-mail:www@gtc.gtca.kumamoto-u.ac.jp