GTC On Line News No.398

******** GTC On Line News No.398*******
　　　　　　２００３年　５月２７日
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＝＝＝　プログラム変更・ABI PRISM 7700 使用説明会　＝＝＝

　生命資源研究・支援センター　バイオ情報分野の荒木です。何度もお騒がせして申し訳ありません。「ABI PRISM 7700 使用説明会」の参加希望者が、既に２０名を越えました。当初予定していたスタイルでは、１０名程度が限度ですので、メーカーと相談してプログラムを大幅に見直すことにしました。まず、機械を機器分析室（５０２）から講義室（６０２）へ移設します。２時間の予定だった使用説明会を、リアルタイムPCRの原理及びアプリケーションの紹介を行うパート１と、「ABI PRISM 7700」の使用方法の説明を行うパート２のふたつに分け、それぞれ９０分ずつ、合計３時間にします。部屋が広くなりましたので、人数制限は行いません。事前申込は不要です。多数の皆様の参加を歓迎いたします。

＝＝＝＝＝　ABI PRISM 7700 使用説明会　＝＝＝＝＝

機　器：ABI PRISM 7700
　　　［アプライド・バイオシステムズ・ジャパン］
日　時：２００３年　６月　５日（木）　１４：００～１７：００
　　パート１　　１４：００～１５：３０
　　パート２　　１５：３０～１７：００
場　所：遺伝子実験施設・６階・講義室（６０２）
説明担当者：勝本　博　氏
　　　アプライド・バイオシステムズ・ジャパン
内　容：
　遺伝子実験施設・５階・機器分析室（502）に設置している「ABI PRISM 7700」は、出発物質の定量を可能にしたリアルタイムＰＣＲ産物分析装置です。ＰＣＲ産物を検出する手段として一般的に行われている方法は、アガロースゲルやアクリルアミドゲルを用いて電気泳動を行い、エチジウムブロマイド（ＥｔＢｒ）などで染色し、ポラロイドカメラで写真撮影を行うという方法です。この方法は、ＰＣＲ産物の大きさを調べるという定性的な実験として大変重要なのですが、定量的なデータを得ることは出来ません。また、ＰＣＲ反応中にラジオアイソトープや蛍光色素を取り込ませることにより、得られた PCR 産物を直接定量する方法もありますが、このようなエンドポイント解析では、ＰＣＲ産物の量は定量出来ますがスタート時のサンプルの量を正確に決定することは不可能です。ABI PRISM 7700 は、このようなＰＣＲ法の欠点を補うために、リアルタイム解析というシステムを導入しています。この方法は、ＰＣＲの各サイクル毎に産生される活性化蛍光色素の量をリアルタイムで検出することにより、10の5乗以上のダイナミックレンジで出発物質の定量を可能にしました。
　今回は、リアルタイムPCRであるTaqMan PCRの原理及び下記新商品の紹介（パート１）と、「ABI PRISM 7700」の使用方法の説明（パート２）を行います。

・Gene Expression assay
・SNP Genotyping assay
・Genomic Assay（Assays-on-DemandおよびAssays-by-Design）
　　Assays-on-Demand：パブリックおよびセレラジェノミクスのデータベース
　　　　　　　　　　　　を使用し、バイオインフォマティクスを駆使してデザ
　　　　　　　　　　　　インされたレディメイドアッセイ
　　Assays-by-Design：お客様よりいただきました配列情報をもとにprimer
　　　　　　　　　　　　probeをデザインするオーダーメイドアッセイ