シーケンス受託のご案内


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<概要>
 DNAの塩基配列に関する『シーケンス受託』事業です。シーケンス反応、電気泳動および解析結果の出力を行います。学内GTC登録者限定のサービスです。(平成16年4月から実施)


<利用方法およびサービス内容>
(1)依頼者は、「シーケンス解析申込書」に必要事項を記入し、テンプレートになるプラスミドDNA(500ng)またはPCR産物(100ng)と共に提出して下さい。GTCの
プライマーリスト(シーケンス用)に載っていないプライマーを使用する場合は、プライマー(10pmol 以上)も持参して下さい。

(2)キャピラリー式シーケンサー[アプライド・バイオシステムズ、ABI PRISM 310]を使用します。ショートキャピラリー(泳動時間約1時間)を使用します。反応キットは「Big Dye Terminator Kit v1.1」を使用します。メーカーの推奨に基づき、反応溶液の希釈はしません。

(3)受託価格は、1検体2000円です。ロングキャピラリーを使用する場合は2500円です。利用者負担金として徴収します。コントロールサンプルについてきれいな解析結果が得られ、依頼サンプルについてきれいな解析結果が得られなかった場合は、テンプレートまたはプライマーに問題があったと考えられます。従って、結果が得られなくても1検体としてカウントします。

(4)解析結果は、プリントアウトした波形データとデータシートを学内便で送ると同時に、読めた塩基配列情報と波形のrawデータ及びPDFデータをメールの本文に添付して送信します。


シーケンスデータは以下のソフトウェアで閲覧可能です。

Sequence Scannerソフトウェア(Windowsユーザーのみ)
http://www.appliedbiosystems.jp/website/jp/product/modelpage.jsp?MODELCD=97746

Mac OS X
4Peaks http://www.mekentosj.com/science/4peaks

[更新2010.4.12]