利用の手引き

熊本大学・遺伝子実験施設

熊本市本荘2−2−1
Tel : (096) 373-6501, FAX : (096)373-6502
2001年 7月30日 更新

【2】主な機器の紹介

[2.2]DNA シークエンサー(LI-COR 4200)

設置場所:
機器分析室(502)
品  名:
DNAアナリシス・システムModel 4200 S-2
LI−COR (米国)

性  能:
 この装置は、2種類の近赤外蛍光色素(IRD700 and IRD800)を個々に検出する2組のレ−ザ−とディテクタを装備しています。この2蛍光システムの採用により、ひとつの反応で、DNAの両端から同時に塩基配列を決定することが可能になりました。また、生デ−タイメ−ジングシステムを採用し、コンスタントに600〜800ベ−ス読めます。

利用者負担金:
 シーケンサー本体の使用料金は取りません。その代わり、シーケンスゲルを作製するた めに、遺伝 子実験施設で購入している「Long Ranger gelsolution(タカラ、F0611)」を使用する場合は、使用記録 ノートの該当欄に使用量(ml)を記入し、1ml あたり100円を試薬代として集めることにしました。 「LI-COR、4200」のプロトコールでは、ゲル1枚につき「Long Ranger」を約7ml 使用しますので700円になります。もちろん、遺伝子実験施設の「Long Ranger」を使わない場合、試薬代は無料です。
 なお、これまで、試薬調製室の試薬棚に保管していた「Long Ranger gel solution 」は、機器分析室 (502)内の「ALFexpress」と「ABI PRISM 7700」の間にある試薬棚に移しました。 最近の傾向として、 ゲルを作製する必要がないキャピラリーシーケンサーに人気が集まり、「ALFexpress」や「LI-COR、4200」を使用する人はあまりいません。しかしながら、キャピラリーシーケンサーと比較した場合、これらのシーケンサーには下記メリットがあります。是非ご利用下さい。

・正確に読める。
・長く読める。
・安く読める。(サンプルが多い場合)


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