【２】主な機器の紹介
［2.3］キャピラリーシークエンサー
設置場所：機器分析室（502）
品 名：ABI PRISM 310
アプライド・バイオシステムズ（米国）
性 能：
ショートキャピラリー（１サンプル約１時間）で３００ベース前後、ロングキャピラリー（１サン プル約３時間）で５００ベース前後読めます。ゲルを作製する必要がありませんので、少ないサンプル でも気兼ねなしに泳動出来ます。
４種類の蛍光色素で標識されたサンプルが、１本のキャピラリーの中 を同時に泳動する訳ですが、 同じ長さのDNAでも結合している色素によって泳動速度が異なります。そこで標準サンプルの泳動結 果に基づいてコンピューターで補正処理した結果が表示されます。生データで比較することは出来ません。
利用者負担金：
平成１６年 ９月３０日まで
１サンプルあたり ショートキャピラリー ２５０円
ロングキャピラリー ３００円
平成１６年１０月 １日から
１サンプルあたり ショートキャピラリー ３００円
ロングキャピラリー ３５０円
☆☆☆ キャピラリーシーケンサーを使用する際のルール ☆☆☆
- 利用者負担金として、１サンプルあたりショートキャピラリーは２００円、ロングキャピラリーは ２５０円集めることにします。使用記録の記入は、確実に行って下さい。
- 使用希望者は「予約」用のカレンダーに、時間・名前・及び内線番号を記入して下さい。もちろん、
遺伝子実験施設利用者登録をしていることが前提になります。
- キャピラリーシーケンサー３台のうち、１号機と３号機をショートキャピラリー専用機、２号機を ロングキャピラリー専用機とします。ポリマーはシーケンス用（POP6）を使用します。フラグメント解析用（POP4）は、購入していません。
- １サンプル泳動するために必要な時間は、ショートキャピラリーが約１時間なのに対して、ロング キャピラリーの方は約３時間かかります。そこで、１回の予約で流せるサンプル数（上限）は、ショートキャピラリーに関しては２４サンプル、ロングキャピラリーに関しては８サンプルとします。
- ポリマーの充填やキャピラリーの交換など、機械の基本的なメンテナンスは遺伝子実験施設スタッフが担当します。週１回のペースです。
- バッファー交換については、２日に１回が基本ですので、使用状況に応じて、自分で交換して下さい。その場合、メンテナンスノートのチェックをお願いします。ポリマーの充填やキャピラリーの交換についても、使用状況に応じて、利用者の方が行っても構いません。ただしポリマーの充填を行う場合、単にシリンジ内にポリマーを追加する方法ではなく、必ず「操作ガイド」の1-20~26ページに記載されている方法で行って下さい。
- Template Suppression Reagent (TSR)、バッファー及びポリマーは、機器分析室内の冷蔵ショーケースに入っていますので、自由にご使用下さい。サンプルチューブ、セプタ、バイアル及びキャピラリー等は、シーケンサーの下の引出しなどに入れていますので、自由にご使用下さい。在庫が少なくなったら、遺伝子実験施設スタッフにご連絡下さい。
- 泳動終了後のサンプルが必要か不要かを示すプレートを作成しました。必要な場合、次に泳動する 人はアルミホイルで遮光し、機器分析室内の冷蔵ショーケースのPCR産物置き場に置いて下さい。
- 使用方法が分からない場合、何かトラブルが発生した場合は、遺伝子実験施設スタッフまでご連絡下さい。
- 予約を入れ、実際に泳動しているのに、使用記録を書かない人がいます。気付いた場合は注意していますが、改善されない場合、『ルール違反者の処置方法についての申合せ』を適用します。
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