熊本大学・遺伝子実験施設
熊本市本荘２−２−１
Tel : (096) 373-6501, FAX : (096)373-6502
２００１年 ３月 ７日 更新
内容：
（１）GTC User Meeting について
（２）キャピラリーシーケンサーについて
（３）スライド作製装置について
「GTC On Line News No.158」でお知らせした様に、新しい
スタイルでGTC-User Meeting(GUM)を再開します。当日、手元
資料として、演者が実際に使用しているプロトコールのコピーを
配付します。遺伝子実験施設利用者でなくても参加できますので、
多数の皆様のご来聴を歓迎します。
・・・・・ＧＵＭ 第６回・・・・・
日時；平成１３年３月２１日（水）１７：００〜１８：００
場所；遺伝子実験施設・６階・セミナー室（６０１）
または 講義室（６０２）
内容；
［パート１］（２０〜４０分）
テーマ：「Whole-mount in situ hybridization法について」
発表者：関本 朝久 氏（発生医学研究センター 臓器形成分野）
要旨：Whole-mount in situ hybridization法の最大の特徴は、組織
切片にしなくても、遺伝子転写物の局在が生体の本来の位置で
三次元的に一目でわかる点であり、現在かかすことのできない
実験法のひとつです。今回はWhole-mount in situ
hybridization法のプロトコールをWilkinsonの方法に基づいて
簡単に説明し、これまでの結果を反省点を含めていくつか提示
します。
［パート２］（１０〜２０分）
〜〜〜利用者及びスタッフの自由な意見交換〜〜〜
遺伝子実験施設に、３台目のキャピラリーシーケンサー（ABI
PRISM 310 Genetic Analyzer）が入りました。先の２台は平成１２
年度研究高度化設備費で購入したものですが、今度の機械は科学技術
振興事業団（ジーントラッププロジェクト）が、発生医学研究センター
臓器形成分野（山村研一教授）のために購入した備品です。従って、
「山村研の備品」なのですが、他の２台と同じ様に遺伝子実験施設の
設備として自由に使用出来ます。設置場所は他の２台と同じ遺伝子実
験施設・５階・機器分析室（５０２）です。キャピラリーシーケンサー
が３台になりましたので、２台目のキャピラリーシーケンサーをロング
キャピラリー専用機にし、１台目と３台目をショートキャピラリー専用
機にすることにしました。これに伴い、使用上のルールを少し見直しま
す。
(a) 利用者負担金は、これまで１サンプル２５０円でしたが、３月から
ショートキャピラリーは２００円に値下げし、ロングキャピラリーの方
を２５０円にします。
(b) １サンプル泳動するために必要な時間は、ショートキャピラリーが
約１時間なのに対して、ロングキャピラリーの方は約３時間かかります。
そこで、１回の予約で流せるサンプル数は、ショートキャピラリーに関
してはこれまでどうり２４サンプル、ロングキャピラリーに関してはそ
の３分の１で８サンプルとします。
(c) 泳動終了後のサンプルが必要か不要かを示すプレートを作成しまし
た。必要な場合、次に泳動する人はアルミホイルで遮光し、機器分析室
内の冷蔵ショーケースのPCR産物置き場に置いて下さい。
(d) 予約を入れ、実際に泳動しているのに、使用記録を書かない人がいま
す。気付いた場合は注意していますが、改善されない場合、『ルール違
反者の処置方法についての申合せ』を適用します。
なお、山村研についてはシーケンサーの利用者負担金を免除します。
これは、「GTC On Line News No.86」でお知らせした、FACSCalibur
及びFACScanについての利用者負担金と同じ処置です。今後同様なケース
（各講座の備品として購入することで遺伝子実験施設の設備更新を行い、
その講座に関しては利用者負担金を免除する）が、さらに続くことを期待
しています。
遺伝子実験施設・６階・遺伝情報解析室（６０６）に、２台目のスライ
ド作製装置［Personal LFR Plus］が入りました。これは、キャピラリー
シーケンサー同様、科学技術振興事業団（ジーントラッププロジェクト）
が、発生医学研究センター臓器形成分野（山村研一教授）のために購入し
た備品です。従って、「山村研の備品」なのですが、山村研に設置するよ
りもＧＴＣに設置する方が有効利用出来ると判断されました。ＧＴＣの設
備として自由に使用出来ます。
なお、接続したコンピューター（PowerMac G4/400）は、平成１２年
度研究高度化設備費で購入した「塩基配列情報解析装置」で、遺伝子実験
施設の備品です。ＤＮＡアナリシス・システム(Model 4200 S-2、米国
ＬＩ−ＣＯＲ社）の解析用ソフト（e-Seq）がインストールされています。