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プライマー・リスト(シーケンス用)

T3 や T7 など、シーケンス反応によく使われるプライマーを大量合成し、小分けしたものです。濃度8ピコモル/マイクロリットルで、50マイクロリットルずつ分注してあります(Total 0.4 nmol)。価格は1本300円です。利用者負担金と同様に、年1回集計します。購入希望の方は、事務室でお申し込みください。

シーケンス反応用のプライマーは、量は少なくて済むのですが、品質が要求されます。PCR用に販売しているプライマーの中には、シーケンスに使用できないものも含まれています。例えば1ベース短い(合成反応の途中で止まっている)物が混ざっていた場合、PCR産物にはほとんど影響はありませんが、シーケンス反応産物は1ベース短い物がずれて泳動されることになりますので、波形が重なって読めなくなります。このシーケンス用プライマーは、希釈、分注後、実際にシーケンス反応を行い、塩基配列が正確に読めることを確認しています。

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1 T3 21 mer 5′-att aac cct cac taa agg gaa-3′ pBluescript II
2 T7 20 mer 5′-taa tac gac tca cta tag gg-3′ pBluescript II
3 M13-F 20 mer 5′-gtt gta aaa cga cgg cca gt-3′ M13 or pUC
4 M13-R 21 mer 5′-agg aaa cag cta tga cca tga-3′ M13 or pUC
9 SP6 24 mer 5′-cat acg att tag gtg aca cta tag-3′ SP6 promoter
10 Z-1 19 mer 5′-gcg tta ccc aac tta atc g-3′ lacZ gene
11 Z-2 20 mer 5′-tgt gag cga gta aca acc cg-3′ lacZ gene
22 ori-1 20 mer 5′-aga ggc ggt ttg cgt att gg-3′ pUC origin
23 ori-2 20 mer 5′-cag tgg cga taa gtc gtg tc-3′ pUC origin
34 HBx-1 20 mer 5′-tct acc gtc ccc ttc ttc at-3′ HBV HBx gene
35 HBx-2 21 mer 5′-caa ttt atg cct aca gcc tcc-3′ HBV HBx gene
60 AG3AS 19 mer 5′-cct gaa gtt ctc agg atc c-3′ rabbit beta-globin gene
61 pSP72-1 19 mer 5′-ggg ctg gct tta cta tgc g-3′ pSP72
62 pSP72-2 20mer 5′-ata gtt aag cca gcc ccg ac-3′ pSP72
63 pSP72-3 20 mer 5′-ata agg gcg aca cgg aaa tg-3′ pSP72
65 pSP72-5 21mer 5′-tca cgt taa ggg att ttg gtc-3′ pSP72
66 pSP72-6 20 mer 5′-tgt agg tat ctc agt tcg gt-3′ pSP72
91 Amp-S 20mer 5′-tac agg cat cgt ggt gtc ac-3′ Amp
92 Amp-As 20mer 5′-aaa tgt gcg cgg aac ccc ta-3′ Amp
128 pSP72-4R 20 mer 5′-aac act gcg gcc aac tta ct-3′ pSP72
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