サンガー法によるDNAのシーケンス受託解析です。シーケンス反応、電気泳動および解析結果の出力を行います。また、シーケンス反応済のサンプルについては、電気泳動および解析結果の出力のみのサービスも行います。解析機器は、3500 Genetic Analyzer (Applied Biosystems, 8本キャピラリー)です。
利用するためには、遺伝子実験施設利用登録が必要です。
お問い合わせ、受付はこちらまで
担当:シーケンス受託担当
E-mail:jutaku(あっとまーく)kumamoto-u.ac.jp
TEL:096-373-6506 (内線:6506) *2020.6.24より番号が変わりました
サンプル受付:遺伝子実験施設6階【605】
黒髪キャンパスから学内便によるサンプル受付が可能です。事前にお問い合わせください。
A.シーケンス反応と泳動
(内容)
○ シーケンス反応および精製
・Big Dye Terminator Kit v3.1またはv1.1 (Thermo Fisher Scientific)
または BrilliantDye™Terminator Cycle Sequencing Kit (Nimagen) **
・エタノール沈殿による精製 *
○ 泳動
○ 解析結果の出力
*2019.4.1より精製方法を Big Dye Xterminator Purification Kit(Thermo Fisher Scientific)からエタノール沈殿に変更しました。
**2020.4月より使用
(負担金)
1サンプル 1200円
(持参するもの)
(1) シーケンス受託依頼書[反応と泳動](記入を済ませて)
シーケンス受託依頼書 ダウンロード
(2) テンプレートになるプラスミドDNA(500ng)または精製済みのPCR産物(100ng)
(3) プライマー(10pmol 以上)
*GTCのプライマーリストに載っているプライマーを使用する場合は必要ありません。
(4) 解析結果は、読めた塩基配列情報と波形のrawデータおよびPDFを、依頼書の記載されたメールアドレス宛に添付またはオンラインストレージサービスProselfでお送りします。
(特記事項)
・一週間以内に結果をお届けします。お急ぎの場合は、依頼の際にお伝えください。
・サンプルの返却はありません。
・テンプレートの精製度が結果に影響することがあります。
・ランモジュールは、依頼書に記載されたPCR産物あるいはインサートのサイズに基づき選択します。
B.泳動のみ
(内容)
○ 泳動
○ 解析結果の出力
(負担金)
1サンプル 500円
(持参するもの)
(1) シーケンス受託依頼書[泳動のみ](記入を済ませて)
シーケンス受託依頼書[泳動のみ]ダウンロード
(2) サンプルは、1.5mlチューブでエタノール沈殿を行い乾燥状態にして、アルミホイルで遮光してご持参ください。
(3) 解析結果は、読めた塩基配列情報と波形のrawデータおよびPDFを、依頼書の記載されたメールアドレス宛に添付またはオンラインストレージサービスProselfでお送りします。
(特記事項)
・一週間以内に結果をお届けします。お急ぎの場合は、依頼の際にお伝えください。
・サンプルの返却はありません。
・テンプレートの精製度が結果に影響することがあります。
・ランモジュールは、依頼書に記載されたPCR産物あるいはインサートのサイズに基づき選択します。
Support
サンガー法シーケンスで最良な結果を得るためのコツやヒントがQ&A形式でまとめられています。
Sanger Sequenceing Support (ThermoFisher)